В настоящее время ТПУ участник 15 ПИР госкорпораций, для 6-и из которых является опорным вузом (ПАО «Газпром», ГК «Росатом», АО «Информационные спутниковые системы имени академика М.Ф. Решетнева», ФГУП «НПО «Микроген», ОАО «Системный оператор ЕЭС», ПАО «РАО Энергетические системы Востока»).

Кроме 6 перечисленных компаний стратегическими партнерами ТПУ являются такие крупные компании, как ПАО «НК Роснефть», ПАО «Транснефть», ПАО «АК «АЛРОСА», ПАО «ФСК ЕЭС», ГК «Ростех», ОАО «РЖД», ПАО «Ракетно-космическая корпорация «Энергия» имени С.П. Королева», ПАО «КАМАЗ» и др.

В рамках ПИР выполняются проекты для:

ГК Росатом

Разработка кодов оптимизации и диагностики технологических для переработки отработанного ЯТ в реакторах на быстрых нейтронах;

- Разработка эффективной технологии   реконверсии обедненного гексафторида урана;

ПАО Газпром

- Разработка системы контроля и анализа факторов внешней среды, оказывающих влияние на коррозионные процессы подземных трубопроводов;

- Разработка отечественного комплекта оборудования для радиоскопического (беспленочного) контроля сварных швов трубопроводов;

ИСС им. М.Ф.Решетнёва АО

- Разработка контрольно-проверочной аппаратуры для изготовления каналов СНА,УПБС и механических устройств БК УПФР, испытания на дозовые эффекты;

- Программа обеспечения устойчивой работы электросетевого комплекса Сахалинской области;

ОАО «ФСК ЕЭС»

- Экспериментальные установки газификации твердых топлив;

ИНТЕР РАО   Схема теплоснабжения города Томска;

Ванкорнефть АО          

- Выполнение строительных, электромонтажных работ и автоматизация по объектам УПСВ-Юг ГКС НД и УПСВ-Север.

В настоящее время в ПИР крупных госкомпаний подано 84 заявки на выполнение НИОКР.

За последние 5 лет ТПУ  выполнял хозяйственные договоры с крупными госкомпаниями на сумму около 2 млдр.руб.  В 2017 заключено  новых договоров на сумму более 80 млн.руб.

Основные заказчики: ПАО Газпром, ООО "Газпром трансгаз Томск", ПАО Томскгазстрой, "Газпром газораспределение Томск", Газпромнефть-ННГГФ  ОАО, Газпром добыча Надым", Газпром нефть шельф ООО, ГК  «Росатом»,  АО СХК НЗХК ПАО, АО ВНИИНМ, АО ИК "АСЭ", АО Информационные спутниковые системы имени академика М.Ф.Решетнёва,  ФГУП НПО Микроген, ОАО «Системный оператор ЕЭС», ПАО «РАО Энергетические системы Востока», ПАО НК «Роснефть», Томскнефть ВНК ОАО, АО Ванкорнефть, Томская нефть ООО, "Иркутская нефтяная компания", ТомскНИПИнефть ОАО, ОАО "Сургутнефтегаз", РН-Няганьнефтегаз ОАО, Славнефть-Мегионнефтегаз ОАО, ПАО «Транснефть», АО «Транснефть – Центральная Сибирь», ПАО АК "АЛРОСА", ОАО «Федеральная сетевая компания Единой энергетической системы», ОАО "РКК "Энергия", ПАО «РОССЕТИ»,             Группа ОАО «Интер РАО», Группа «ЛУКОЙЛ» и др.